L'histoire :
La base de la Fédération Galactique subit les attaques des Space Pirates. Samus se voit confier la mission de redémarrer le générateur pour rétablir les systèmes de défense. Mais à l'issue de sa mission, un terrible ennemi l'attend.
Personnages :
Samus, Samus Sombre, la Fédération Galactique et de nombreux nouveaux chasseurs de primes.
La guerre initiée par Samus Sombre et les Space Pirates fait rage sur de nombreuses planètes que ces derniers essaient de corrompre avec des graines de Phazon. Le joueur dispose de la manette Wii et de son périphérique nunchaku pour explorer les environnements extra-terrestres, rechercher des armes et des informations et détruire les graines. Mais sauver ces planètes de la corruption ne suffira pas. Finalement, le joueur devra affronter l'ennemie mortelle de Samus : Samus Sombre.
Pouvoirs spéciaux / armes / mouvements :
En plus d'utiliser la manette Wii et son périphérique nunchaku pour réaliser les mouvements les plus incroyables comme cibler et tirer en plein saut ou même en courant, le joueur disposera également d'un arsenal varié. Comme dans tout bon jeu Metroid, ces armes bénéficieront de mises à jour au fil du jeu. Et en plus, la manette est également utilisée pour un certain nombre d'actions en marge des standards du FPS traditionnel.